Για την υλοποίηση του Έργου ακολουθήθηκαν όλες οι απαιτούμενες από την Ελληνική Νομοθεσία αδειοδοτήσεις, όπως και οι απαιτούμενες περιβαλλοντικές μελέτες.
Για το Έργο εκπονήθηκε Στρατηγική Μελέτη Περιβαλλοντικών Επιπτώσεων (ΣΜΠΕ), σύμφωνα με τις απαιτήσεις της εθνικής και ευρωπαϊκής νομοθεσίας. Η ΣΜΠΕ είχε ως στόχο να αξιολογήσει συστηματικά τις πιθανές περιβαλλοντικές επιπτώσεις του σχεδιασμού, της εγκατάστασης και της λειτουργίας του νέου υβριδικού συστήματος, το οποίο συνδυάζει Ανανεώσιμες Πηγές Ενέργειας (Α.Π.Ε.) με μονάδες αποθήκευσης και συμπαραγωγής.
Στο πλαίσιο της μελέτης, εξετάστηκαν εναλλακτικά σενάρια χωροθέτησης και τεχνολογικού σχεδιασμού, καθώς και τα οφέλη για το φυσικό και ανθρωπογενές περιβάλλον του νησιού. Ιδιαίτερη έμφαση δόθηκε στη μείωση των εκπομπών ρύπων, στην ενεργειακή αυτονομία και στη διατήρηση του ιδιαίτερου φυσικού τοπίου του Αγίου Ευστρατίου.
Η ΣΜΠΕ αποτέλεσε βασικό εργαλείο λήψης αποφάσεων και περιβαλλοντικής δειοδότησης του έργου, διασφαλίζοντας την αειφόρο ανάπτυξη και την προστασία του περιβάλλοντος του νησιού.
Μετά την ολοκλήρωση και αξιολόγηση των περιβαλλοντικών μελετών (ΣΜΠΕ) από τις αρμόδιες αρχές εκδόθηκε η Απόφαση Έγκρισης Περιβαλλοντικών Όρων (ΑΕΠΟ), που καθορίζει τους όρους και τους περιορισμούς υπό τους οποίους επιτρέπεται η υλοποίηση και λειτουργία ενός έργου.
Σκοπός της ΑΕΠΟ είναι να διασφαλίσει ότι το Έργο θα υλοποιηθεί με τρόπο που θα ελαχιστοποιεί τις αρνητικές επιπτώσεις στο περιβάλλον, θα τηρεί τους περιβαλλοντικούς όρους που τίθενται για την προστασία του φυσικού και ανθρωπογενούς περιβάλλοντος και θα παρακολουθείται και θα ελέγχεται σύμφωνα με συγκεκριμένα περιβαλλοντικά πρότυπα.
Για τις ανάγκες του Έργου κρίθηκε απαραίτητη η διαμόρφωση ενός ειδικού καθεστώτος που να αφορά τη διαχείριση και λειτουργία του νέου ηλεκτρικού συστήματος του Αγίου Ευστρατίου, καθώς και τις ειδικές διαδικασίες αδειοδότησης του ενιαίου Έργου, τις αρχές τιμολόγησης και τη μορφή της λειτουργικής ενίσχυσης.
Το εν λόγω καθεστώς διαμορφώθηκε μέσα από διαδοχικές διαβουλεύσεις μεταξύ των αρμόδιων θεσμικών φορέων (ΥΠΕΝ, ΡΑΑΕΥ, ΔΕΔΔΗΕ), με πρωτοβουλία του ΚΑΠΕ και την επιστημονική υποστήριξη του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου (ΕΜΠ), του οποίου η συμβολή στον σχεδιασμό του Έργου υπήρξε καθοριστική και πολύτιμη.